ROI选取问题：在哪个方位上和哪种增强时期上勾画ROI？

quaresma00

请教下，肿瘤ROI选取只在薄层为1mm的横断面上选取，而不去矢状位和冠状位上选取，会有问题吗？因为有些临床上不可能再各期扫描都做三位像，那么上传的片子太多了

Pika

你之前没怎么接触过DICOM图像吧？影像科的同事一般都知道，（MR除外）原始数据都是轴位的，矢状位和冠状位是扫描采集后人工或机器自动通过原始轴位数据重建的。不知道你用的什么软件，一般的ITK或者Slicer你在画轴位画ROI，他会同步到矢状位和冠状位的windows上，你在薄层的轴位上勾画完ROI，其实就已经是一个拥有三维信息的病灶了，比如3D Slicer你勾画完病灶后可以在 segmentation - Show 3D 里看到你画的病灶的三维形态。

quaresma00

强璐我是临床的，我们医院CT新来一个机器，它有一个特殊显像序列，上传给临床看到的我能获取的只有轴状位，没有矢状位和冠状位，我就打算只在特殊显像的轴状位那序列去画ROI，去做特征提取，是否可行

Heru

强璐那老师，这是否意味着MRI勾画需要进行冠状位和矢状位图像的勾画呢

Pika

quaresma00 CT的特殊显像序列？能告知一下具体是什么吗，在我的认知中CT没有什么特殊序列，除非是融合代谢或者双源能谱之类的

quaresma00

强璐 iqon光谱CT，临床看片觉得这个序列很清晰，能提供很多信息，我pubmed搜iqon也只有24篇，没有肿瘤方向，我觉得针对iqon光谱CT成像的序列去做影像组学应该很有意义

Pika

quaresma00 超出我的认知范围了，没法给到你建议，抱歉😭

quaresma00

强璐谢谢啊，但是我还是想请教下，就假设一个扫描肿物的CT，我只对一个序列（先不讨论平扫或增强）的轴状位去做ROI是可以的吗？还是三个位都要画ROI

Pika

quaresma00 只用选择其中一个方位画即可，对于DICOM图像来说，你看到的图像都是切片，实际一个扫描序列是一个空间信息，你可以从任何一个切面去画你想要的病灶，最终画完都是同样的三维信息。你可以理解成：一个CT扫描序列完成后，所有的DICOM图像则是扫描范围那个圆柱形里所有的密度和空间信息，默认是通过正轴位去查看每一层切面的信息，但是你可以通过MPR，像超声一样去看任何方位的切面，在任何切面你画出来的病灶理论上来说在这个圆柱形的空间里都在同一个位置，形态也完全一样。说的有点乱，你看着理解一下。

quaresma00

强璐非常感谢分享知识，占用你时间再请教下：对于ROI我看文献其实还不是太理解，就比如肿瘤，画ROI是选择平扫、动脉期、静脉期中的一个还是全部，假设是全部那提取的特征应该一个病人有多个特征表，那后续对每个序列去做分析？应该还是选单个序列吧，我看2016年JCO的Development and Validation of a Radiomics Nomogram for Preoperative Prediction of Lymph Node Metastasis in Colorectal Cancer，他是选择门脉期，因为他认为门脉期可以把肿瘤和肠管区分清楚。这个序列选择上有没有什么标准，或者经验可以分享下？谢谢！！

Pika

quaresma00 刘主任给我们讲了好几次他指导学生做这个文章里的内容时的想法；具体肿瘤具体分析，比如胰腺癌是乏血供肿瘤，在动脉期的时候胰腺实质明显强化而肿瘤强化不明显，静脉期和延迟期胰腺实质强化减低，肿瘤仍然强化不高，这种肿瘤就更适合做动脉期的勾画；再比如典型HCC，动脉期明显强化而正常肝实质强化不明显，门脉期肿瘤强化迅速减退，肝实质明显充填强化，这两个特征缺一不可，仅有动脉期强化高于肝实质，也有可能是FNH、腺瘤或者血管瘤，仅有静脉期强化低于肝实质，那有可能是转移瘤、纤维板层肝癌、胆管癌，所以对于HCC的研究，就建议同时勾画动脉期和静脉期。以上，这是我个人的看法，你们医院有这么先进的设备，应该是个很顶级的医院了，你也可以跟你们医院影像科的同事交流一下，他们一定比我知道的更多。

quaresma00

强璐谢谢解决我初入影像组学的疑惑，十分感谢，感谢这个论坛，能毫不吝啬的传授知识，谢谢！！！如果未来我能发个影像组学的SCI，致谢部分有东西写了🤗

Pika

Heru 连续层面勾画病灶后，你的勾画ROI也是具有空间三维形态的，无论CT还是MR，不管是那个切面，都是具有层厚这个概念的。