Editor 群里有人说见过,难说
李任远 请教一下,如果我将dcm格式文件转为jpg格式文件,然后用代码设置矩形框(坐标我还保留着)裁剪出了大致的ROI区域,也是jpg格式的。现在我想用pyradiomics提取特征,我该怎么做呢?我看提取取器需要两个参数,一个原图,一个mask。 我需要把裁剪出的ROI区域图片转化为nii吗?转回nii对信息有没有影响? 还是说我前面的步骤不太对,需要重新做一下? 拜托您指点一下,谢谢了!!!
loveling 你好,我遇到了和你一样的问题,请问能进一步向你请教下问题吗?
感谢,解惑了
李任远
老师,您好!用于影像组学特征提取的MRI图像,由DICOM转为NIFTI格式。随后ITK-SNAP打开sub001_T1WI.nii文件,文件显示有冠、矢、轴三个层面图像,但只有矢状位图像是清楚的,可阅片的,冠状位和轴位模糊不清。若继续在矢状位画ROI,此类MRI图像是否可用于特征提取?
med_student 一般来说是可以的,但也要具体看一下模糊到什么程度。
谢谢 老师
李老师,我手里有些超声图像,是直接从机器导出的病变区域淋巴结的灰度图、弹性成像还有微血流,都是BMP格式,机器导出DICOM是附加功能,我们医院没有买,想请教一下,这种情况,应该用什么方法画ROI出来啊?
wucen 你可以查一下超声影像深度学习的文献,肯定会有部分文献提及详细使用的软件或方法。
Editor 现在有将JPG转为nii格式再提特征的
我见过一些超声的文章是jpg,tiff都有在做,有一篇还是来自田捷教授团队的文章。好像区别是小滤波的数量会变少
而且我自己做过,超声不管是存在机器或者工作站,它都是一个8bit的图像。对于图像矩阵来说,DICOM和JPG都是一样的,差别是DICOM是三维(第三维度只有1层),JPG只是二维。
lm7 您好我手上有一部分超声的图像,是jpg格式的。但是我不知道自己的图像质量是否可以做。可以像您请教下吗。
超声工作站导出的JPG格式150kb,BMP格式550k。信息中心导出的DICOM格式1200kb。
我也是小白,但是如果超声二维图片的深度学习,最好还是使用DICOM格式。
请各位老师批评指正!
bbs 试过了,提取的特征反映不出问题