• 问与答
  • 如何通过3Dslicer测绘第三腰椎水平内脏脂肪面积及皮下脂肪面积

  • DDRn

      Lv. 1

    (1) 我的问题是?
    →3Dslicer绘画内脏脂肪组织,选定第三腰椎水平。内脏脂肪阈值设定为-150至-50,皮下脂肪面积设置阈值为-190至-30。通过segment statistic计算surface所测得的面积偏大很多。求教各位老师要怎么计算内脏脂肪面积和皮下脂肪面积。

      你截图看看你的分割情况呢?填孔和生长后再试试?

      • DRn 回复了此帖
        • DDRn

            Lv. 1

          强璐

          老师,这个是我当时勾画的模型,下面的surface是计算出的面积。具体方法我是先定位到第三腰椎,然后选取阈值为-150至-50(内脏脂肪),勾画出绿色区域,然后选取阈值为-190至-30(皮下脂肪),勾画出橙色区域,但是最后算出来就有点问题了,勾画出来的面积过大

            • 强璐

              Lv. 85
            • 已编辑

            我都忍不住找饶罗翔老师教你怎么截图了!

            我按照你的流程操作了一遍,虽然阈值分割由于噪声SD过高导致轮廓非常难看,但计算结果无误,约46cm2 。你的计算出问题,很大概率是你的阈值分割范围超出了这一层面。建议你使用布尔运算或岛(Island)工具将阈值分割的mask限定在当前选层。

            • DRn 回复了此帖
              • DDRn

                  Lv. 1

                强璐 好的好的,谢谢老师!我试着去学一下这两个操作,感谢老师解答!

                  6 天 后

                  强璐 老师,我尝试了一下重新画图,但是感觉跟您画的不大一样,结果测绘出来也是偏大的<img class=">,不知道那个地方出了问题,可以加老师联系方式我发您操作的视频么,谢谢老师

                    DRn

                    看到我框出来的地方的绿线了吗,说明你在这层也有相应的ROI。你自己核对下吧,计算机做算数从来不出错,明显过大肯定是你多画了一些地方。注意一点阈值分割会自动对所有图像所有层面做处理,你如果只想限定在一层,注意先设定好masking限定,或者分割完了做布尔运算。要不你就用SAM模块设好目标层面去全自动勾画,再不然你就手动画一层看看。

                      你这种单个层面的ROI像素都连到一起的,很适合用island工具一键保留单个层面的区域,就在segment editor里找。

                      • DRn 回复了此帖

                        强璐 好的,谢谢老师!我再去试试我画的图总感觉单层面积大了很多

                          说点什么吧...