(1) 我的问题是?
→使用官方的Demo数据和程序操作Mrtrix,在构建SC矩阵(使用streamline的数量构建)时出现[WARNING] The following nodes do not have any streamlines assigned[WARNING] (This may indicate a poor registration),而且结果和Demo的结果相关不高(r = 0.44),但是配准没有什么问题,反而是自己做5ttgen fsl的问题,不是自己做把demo的5ttgen的结果用于后续分析,最终得到的SC矩阵与demo的SC矩阵相关高(r = 0.93)且无警告。想请教各位老师有解决这个问题的经验吗?
(2) 为解决此问题我查阅过哪些资料?
→Mrtrix官方文档,Chatgpt
(3) 我做过哪些尝试解决该问题?
→换了freesurfer方案做5ttgen 仍然有上述warning。
(4) 目前我对该问题的反思和猜测是?
→使用openneuro的数据进行练习的时候,5ttgen选择freesurfer,模版使用aparc.a2009s+aseg,没有出现类似warning。可不可能这个数据本身就有点问题,然后教程本身就不是用5ttgen生成灰质、白质和脑脊液以及病理组织的?