特征映射实现影像组学特征的可视化是将特征值映射回原始医学图像上的对应体素,从而直观地展示特征在图像中的分布。通过特征映射,我们可以观察到哪些区域与特定特征更相关,以便更好地理解病变或生物过程。
实现特征映射可视化的基本步骤如下:
提取基于体素的特征:首先,需要从医学图像中提取基于体素的影像组学特征。这意味着计算每个体素的特征值,并将它们保存为与输入图像具有相同维度的数组。这可以通过像PyRadiomics这样的工具库来实现。
选择合适的颜色映射:为了清楚地展示特征值的分布,需要为特征值选择一个合适的颜色映射。常用的颜色映射有“热图”(jet或hot)或“冷热图”(coolwarm)等,它们可以在低值和高值之间提供明显的视觉区分。
叠加特征映射到原始图像:将特征值数组与原始医学图像叠加,以便在图像中可视化特征值的分布。为了保留原始图像的信息并突出显示特征映射,可以将特征映射设置为半透明。
可视化多个特征映射:如果有多个特征需要可视化,可以将它们并排展示,以便进行比较。在这种情况下,确保在所有映射中使用相同的颜色映射和值范围,以便更容易地进行比较。
提供交互式探索工具:对于具有多个切片的三维医学图像,可以提供交互式工具来浏览各个切片,并查看不同切片上的特征映射。这可以通过图形用户界面库(如 PyQt、Tkinter 或 web-based 工具如 Plotly 或 Dash)实现。
特征映射可视化有助于了解特征在图像中的空间分布,揭示病变和生物过程的模式,为医学研究和临床诊断提供有价值的见解。