(1) 我的问题是? →请问3d slicer勾画完ROI后,应该如何导出pyradiomics需要的两个文件呢?例如pyradiomics提供的示例:一个image.nrrd,一个label.nrrd。我的方法是:
(2) 为解决此问题我查阅过哪些资料? →B站、微信公众号、pyradiomics官方
(3) 我做过哪些尝试解决该问题? →
(4) 目前我对该问题的反思和猜测是? →
这没什么问题啊,nrrd实际上就是封装了DICOM图像和XML文件的
文件特别大那个,应该包含了所有原图,患者的扫描图像越多文件越大,对应 image.nrrd
带有segment字样的nrrd,就是你勾画平面的坐标,对应label.nrrd,实际上他只存了几个坐标点的文本数据,你只画一层,大小只有1KB是很正常的啦。
强璐 感谢回复!
我那个对应image.nrrd的文件,大约170MB,远远超过pyradiomics给出的例子数据brain1_image.nrrd(1.92MB),是我导出错误了吗,为啥他们这个brain1文件这么小。
我的对应label.nrrd文件有1112KB,也远超pyradiomics给出的例子数据brain1_label.nrrd(7.34KB)。而且我只勾画了一个层面。
主要问题就是,我这俩文件很大,总怀疑哪里导出错误
radof
image.nrrd 170MB你觉得有点大,那你的原始DICOM文件有多大?
segment的文件有1MB,你是不是导出的时候没有勾选压缩?
你可以勾选后重新导出试试
感谢!我试试