常用的影像组学分析工具和软件有很多,以下是一些比较流行的工具及其功能和特点:
PyRadiomics(https://github.com/Radiomics/pyradiomics): 功能:PyRadiomics 是一个基于 Python 的影像组学特征提取库,提供了许多常用的特征提取方法。 特点:支持多种医学影像格式,如 DICOM、NIfTI、ITK 等;允许用户自定义参数;具有丰富的文档和示例;与其他Python库(如 SimpleITK、NumPy、Pandas 等)兼容。
3D Slicer(https://www.slicer.org): 功能:3D Slicer 是一个开源的医学影像处理和可视化平台,通过 SlicerRadiomics 插件提供影像组学分析功能。 特点:支持多种医学影像格式;具有强大的影像处理和分割功能;提供可视化界面;插件式架构允许用户定制功能。
LIFEx(http://www.lifexsoft.org): 功能:LIFEx 是一个用于放射性核素学、MRI 和 CT 图像的影像组学特征提取和数据分析的软件。 特点:支持多种医学影像格式;提供可视化界面;具有一些内置的统计分析功能;支持 Windows、Mac 和 Linux 平台。
IBEX(http://bitbucket.org/radiomics/ibex): 功能:IBEX 是一个开源的 MATLAB 工具箱,用于从医学图像中提取影像组学特征。 特点:包含丰富的特征提取方法;具有分析和可视化功能;与 MATLAB 环境兼容,方便用户进行进一步的分析和开发。
CERR(https://github.com/cerr/CERR): 功能:CERR(Computational Environment for Radiotherapy Research)是一个基于 MATLAB 的开源软件,主要用于放射治疗计划的导入、处理和可视化,同时支持影像组学特征提取。 特点:支持多种医学影像格式;具有强大的影像处理功能;提供可视化界面;与 MATLAB 环境兼容,方便用户进行进一步的分析和开发。
以上工具和软件具有各自的特点和优势,根据实际需求和技术背景,用户可以选择合适的工具进行影像组学分析。