今日代码
dicom到nifti格式转换(afni)
dcm2niix_afni -o “dwi_nifti” -f %p -z y dwi_dicom
-o 输出路径
-f 输出文件名
-z 输出影像文件是否压缩
影像的volume分割(fsl)
fslsplit <input> [output_basename]
文件名修改(Linux)
mv <source> <target>
去脑壳(fsl)
bet <input> <output> -f 强度 -m(生成mask文件)
影像的数值计算(fsl)
fslmaths
-div 除法
-log 自然对数
今日公式
ADC= [ln(S1/S2)]/(bS2 - bS1)
ln(S1/S2) = lnS1 - lnS2
下期预告:DTI基础。